L‘équipe du CEFRA a développé des compétences dans plusieurs domaines tels que la biologie et le contrôle de la reproduction, le déterminisme du sexe, la sélection génétique et l’amélioration de la croissance, la bioénergétique et l’alimentation et le stress chez les poissons.
Les études sont principalement réalisées sur des espèces modèles tropicales : le tilapia du Nil, Oreochromis niloticus et le poisson-chat africain, Clarias gariepinus. Une importante expertise a également été acquise chez d’autres espèces, provenant notamment des régions tempérées (perche commune, Perca fluviatilis; sandre européen, Sander lucioperca; barbeau fluviatile, Barbus barbus; hotu, Chondrostoma nasus; carpe, Cyprinus carpio).